核心技术

PICT技术简介

PICTPeptide Information Compression Technology)为湖南中晟全肽独家拥有的专利技术,该技术利用生物学手段对多肽信息进行压缩,可将多个多肽的信息集成进一个多肽,从而实现以相对较小的库容包含较大的多肽信息量。

什么是多肽化合物全库

多肽全库即为包含所有多肽的库,这个库的大小根据多肽大小而有所不同。天然氨基酸总计有20种,因此如果需要包含所有的2肽,那么库容需要为20*20=400个;如果需要包含所有的3肽,那么库容需要为8000个;如果需要包含所有的4肽,那么库容需要为160000个,依次类推。

PICT构建多肽全库的原理和信息压缩效率

如下图所示:一个线性化的3肽包含2段2肽,一个环化的3肽包含3段2肽,因此一个70氨基酸的非重复环肽将包含70个不同的2肽、70个不同的3肽、70个不同的4肽、70个不同的5肽、70个不同的6肽、……、70个不同的69肽和70个70肽,总计含有的多肽种类为4830种,也即多肽信息被压缩4830倍。

以常见的5肽为例,包含所有5肽的库容需要为3,200,000个,按70倍压缩比计算,最少只需要45715个多肽的库容即可,极大减少了建库所需的工作量。更重要的是,按此概念建成的5肽化合物库不仅包含了所有3,200,000个5肽信息以及所有的4肽、3肽和2肽的氨基酸序列信息,而且还包含了很多6肽、7肽、8肽。。。一直到70肽的氨基酸序列信息,最终可以实现由约数万个多肽编码约数亿个多肽信息的结果。

PICT构建多肽化合物库的过程

技术优势

相对于传统的化学合成多肽库的优势:

  • 包含了比传统化学合成多肽库信息量大得多的多肽化合物氨基酸序列。
  • 在有限的多肽化合物数量下压缩了更多活性成分,筛选效率更高、成本更低。
  • 化学合成的多肽库通常为短肽,而中晟全肽提供的多肽化合物不仅包含小、短肽的信息,也包含了很多大肽的信息,和靶标蛋白分子的相互作用的几率更高,更有利于筛选出高亲和力的活性分子。
  • 建库成本超低,建库时间很短。
  • 重建过程非常简便。

相对于传统的噬菌体展示技术等方法建立的混合多肽库的优势:

  • 库内各化合物均为独立生产,均经过质谱鉴定和精确称量,保证了筛检的准确和稳定,避免了传统的噬菌体库等混合化合物库的失真(实际库容远低于理论值)问题。
  • 库内化合物可进行混合或单一筛选,筛选方式多样灵活,避免了纯混合物库筛选时各组分的互相干扰。
  • 库内的多肽为环形约束肽,结构稳定性更强,有利于筛选出高活性多肽。
  • 重新生产库内各化合物的过程非常简易且成本很低。
  • 化合物以96孔板的冻干粉末的形式分装,便于高通量筛选。
  • 可直接进行以细胞功能为基础的靶标功能性筛选,也可使用斑马鱼、线虫等活体动物进行筛选,而不是局限于混合多肽化合物库大多以分子间亲和力结合实验的筛选方法。